Sekolah Tinggi Agama Islam Muhammadiyah Tulungagung (kemudian disebut STAI Muhammadiyah Tulungagung atau STAIM Tulungagung) merupakan perguruan tinggi swasta berkedudukan di wilayah administratif Kabupaten Tulungagung Provinsi Jawa Timur yang diselenggarakan oleh Persyarikatan Muhammadiyah, melalui Majelis Diktilitbang.

Berdiri pada Tanggal 23 Oktober 1987 sesuai surat izin operasional bagi perguruan tinggi agama Islam swasta (PTAIS) yang berada dalam lingkungan Koordinatorat Perguruan Tinggi Agama Islam Swasta (KOPERTAIS) Wilayah IV dengan nama Fakultas Tarbiyah Universitas Muhammadiyah Surabaya (UMS) di Tulungagung, dengan SK nomor 354/K/F-9/P/87 yang ditandatangani oleh Rektor IAIN Sunan Ampel selaku Ketua Kopertais IV Wilayah Surabaya. Pada Tahun 1990 mengalami perubahan status menjadi Sekolah Tinggi Ilmu Tarbiyah Muhammadiyah Tulungagung (STIT Muhammadiyah Tulungagung) sesuai SK nomor Dj./219/210.

Untuk memenuhi kebutuhan masyarakat akan pendidikan, pada Tahun 2007 dibuka prodi baru Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah (PGMI), selanjutnya di Tahun 2010 dibuka Program Studi baru yaitu Ekonomi Syari’ah , sekaligus alih status menjadi Sekolah Tinggi Agama Islam Muhammadiyah (STAIM) Tulungagung sesuai SK nomor Dj.I/200/2010.

3 (tiga) Program Studi STAIM Tulungagung

1. Pendidikan Agama Islam (PAI) dengan riwayat akreditasi pada tahun 2007-2013 peringkat akreditasi B sesuai dengan SK BAN PT nomor 001/BAN-PT/Ak-X/S1/I/2007, kemudian ditahun 2013-2018 peringkat akreditasi C sesuai SK BAN PT nomor 097/SK/BAN-PT/Ak-XV/S/II/2013, mengalami peningkatan ditahun 2016-2021 peringkat akreditasi yaitu B sesuai SK BAN PT nomor 0102/SK/BAN-PT/Akred/S/III/2016 dan pada tahun 2021-2026 peringkat akreditasi B sesuai SK BAN PT nomor 1336/SK/BAN-PT/Ak-PPJ/S/III/2021.
2. Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah (PGMI) dengan peringkat akreditasi C sesuai dengan SK BAN PT nomor 008/BAN-PT/Ak-XIII/S1/VII/2010 berlaku tahun 2010-2015, Kemudian tahun 2013-2018 peringkat akreditasi C sesuai SK BAN PT nomor 024/SK/BAN-PT/Ak-XV/S/I/2013, tahun 2015-2020 peringkat akreditasi C sesuai nomor SK-BAN-PT nomor 1167/SK/BAN-PT/Akred/S/XI/2015 dan tahun 2022-2025 mendapat peringkat akreditasi BAIK sesuai SK BAN-PT nomor 7003/SK/BAN-PT/Ak.KP/S/X/2022.
3. Ekonomi Syari’ah dengan peringkat akreditasi C sesuai dengan SK BAN PT nomor 145/SK/BAN-PT/Akred/S/V/2014, pada tahun 2016-2021 peringkat akreditasi C sesuai SK BAN-PT nomor 0102/SK/BAN PT/Akred/S/III/2016 dan pada tahun 2022-2026 mendapat peringkat akreditasi BAIK sesuai SK BAN-PT nomor 6647/SK/BAN-PT/Ak.KP/S/X/2022.